Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc9Q9JHI7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms