Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tcirg1Q9JHF5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms