Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms