Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Brd4Q9ESU6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms