Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc4Q9ES56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms