Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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