Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn2Q9ER65 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms