Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kcnn1Q9EQR3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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