Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf1Q9EPU4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf1Q9EPU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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