Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tlr1Q9EPQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms