Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sil1Q9EPK6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms