Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms