Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Xab2Q9DCD2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms