Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms