Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf1Q9DBU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms