Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem43Q9DBS1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem43Q9DBS1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms