Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms