Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms