Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms