Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KnstrnQ9D9Z1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KnstrnQ9D9Z1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms