Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms