Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms