Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms