Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tmem54Q9D7S1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tmem54Q9D7S1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmem54Q9D7S1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tmem54Q9D7S1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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