Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn23Q9D7D7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn23Q9D7D7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn23Q9D7D7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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