Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms