Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb8Q9D6J5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms