Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms