Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms