Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms