Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms