Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms