Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lonrf3Q9D4H7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lonrf3Q9D4H7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms