Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clvs1Q9D4C9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms