Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D454 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D454 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D454 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D454 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D454 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D454 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D454 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D454 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D454 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D454 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D454 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D454 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D454 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D454 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D454 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms