Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stx11Q9D3G5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx11Q9D3G5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms