Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Trmt44Q9D2Q2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Trmt44Q9D2Q2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Trmt44Q9D2Q2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Trmt44Q9D2Q2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Trmt44Q9D2Q2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Trmt44Q9D2Q2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Trmt44Q9D2Q2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Trmt44Q9D2Q2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Trmt44Q9D2Q2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt44Q9D2Q2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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