Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsig1Q9D2J4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsig1Q9D2J4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsig1Q9D2J4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms