Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms