Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl34Q9D1R9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms