Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cysrt1Q9D1E4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms