Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd3Q9D176 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms