Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Zbed3Q9D0L1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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