Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pbdc1Q9D0B6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pbdc1Q9D0B6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms