Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spc24Q9D083 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms