Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms