Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp11Q9CZJ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms