Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snf8Q9CZ28 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms