Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gins3Q9CY94 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gins3Q9CY94 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms