Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms